More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0968 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  60.08 
 
 
258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  50 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  33.99 
 
 
258 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  32.41 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  30.35 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  28.35 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  28.12 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  26.33 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  28.06 
 
 
375 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.81 
 
 
277 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  37.3 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  33.96 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26.82 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  36.51 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  36.94 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  26.84 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.77 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.67 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  24 
 
 
399 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  32.54 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  22.02 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  24.9 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  29.6 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35 
 
 
138 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.9 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.71 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  24.6 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.53 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
769 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
225 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  26.92 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 
386 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  23.14 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  27.54 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.09 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  27.71 
 
 
385 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.4 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 
152 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
148 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  24.05 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
214 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  28.91 
 
 
149 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  24.85 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
152 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  28.12 
 
 
147 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1731  putative signal transduction protein with CBS domains  23.35 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  27.86 
 
 
160 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  25.78 
 
 
147 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  28.12 
 
 
147 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  27.11 
 
 
688 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  25 
 
 
688 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  24.41 
 
 
492 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  30.65 
 
 
865 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  27.65 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 
133 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.22 
 
 
845 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.34 
 
 
152 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  26.15 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.66 
 
 
153 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.15 
 
 
224 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.48 
 
 
128 aa  55.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
279 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  32.04 
 
 
168 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
134 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  24.15 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  25.4 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.42 
 
 
513 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.57 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  26.92 
 
 
413 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  25.73 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 
171 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.74 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  25.61 
 
 
511 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  28 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.97 
 
 
503 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  25.2 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 
873 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  33.88 
 
 
496 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  28.4 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.13 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>