More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2162 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  57.01 
 
 
863 aa  919    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  52.75 
 
 
879 aa  821    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  74.65 
 
 
859 aa  1248    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  53.79 
 
 
897 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  53.6 
 
 
875 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
862 aa  1727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  55.72 
 
 
863 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  52.75 
 
 
879 aa  821    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  45.54 
 
 
859 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.05 
 
 
597 aa  221  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.7 
 
 
569 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29991  putative chloride channel  34.51 
 
 
450 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.593355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18351  putative chloride channel  33.33 
 
 
452 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.31 
 
 
582 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2297  putative chloride channel  33.71 
 
 
460 aa  192  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.73973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  34.89 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  32.71 
 
 
452 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  30.45 
 
 
600 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  32.48 
 
 
608 aa  188  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.41 
 
 
577 aa  187  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  30.02 
 
 
615 aa  187  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.42 
 
 
584 aa  187  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.16 
 
 
598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.59 
 
 
526 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1794  putative chloride channel  31.31 
 
 
452 aa  184  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  31.92 
 
 
452 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21821  putative chloride channel  33.64 
 
 
452 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.607028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  29.84 
 
 
626 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  36.8 
 
 
533 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  25.17 
 
 
764 aa  182  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.77 
 
 
580 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.98 
 
 
613 aa  181  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  31.59 
 
 
519 aa  181  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  35.28 
 
 
463 aa  180  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  34.47 
 
 
510 aa  180  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.89 
 
 
614 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  31.59 
 
 
519 aa  178  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  30.84 
 
 
452 aa  177  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.17 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
628 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.94 
 
 
473 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.94 
 
 
473 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.94 
 
 
473 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.06 
 
 
591 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
636 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.71 
 
 
473 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.48 
 
 
754 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.71 
 
 
473 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
579 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
579 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 
579 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  31.32 
 
 
466 aa  174  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2668  putative chloride channel  35.53 
 
 
481 aa  174  9e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.51 
 
 
669 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.48 
 
 
591 aa  171  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  33.92 
 
 
479 aa  170  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.47 
 
 
606 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  30.42 
 
 
538 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  39.09 
 
 
539 aa  168  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.72 
 
 
613 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.22 
 
 
590 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.14 
 
 
523 aa  167  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.93 
 
 
598 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  33.33 
 
 
467 aa  165  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  31.9 
 
 
523 aa  166  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.36 
 
 
587 aa  166  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.51 
 
 
593 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  33.02 
 
 
468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.98 
 
 
589 aa  164  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.48 
 
 
593 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  38.36 
 
 
455 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  30.71 
 
 
603 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.66 
 
 
612 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.12 
 
 
563 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.88 
 
 
589 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  33.51 
 
 
470 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.31 
 
 
594 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  32.83 
 
 
478 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.01 
 
 
589 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.47 
 
 
612 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  32.83 
 
 
478 aa  159  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.01 
 
 
589 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  32.83 
 
 
478 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  29.02 
 
 
528 aa  158  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  30.19 
 
 
512 aa  157  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.1 
 
 
577 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.23 
 
 
593 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.48 
 
 
591 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  32.94 
 
 
468 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  35.58 
 
 
472 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  33.33 
 
 
456 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  25.86 
 
 
617 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  29.01 
 
 
584 aa  153  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  32.3 
 
 
427 aa  151  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30.68 
 
 
510 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.22 
 
 
470 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  30.36 
 
 
518 aa  150  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  32.76 
 
 
512 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.56 
 
 
464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.01 
 
 
631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>