More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0301 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  50 
 
 
258 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  37.15 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  34 
 
 
258 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  30.68 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  29.02 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.5 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  38.46 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  26.53 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.3 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  36.52 
 
 
143 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.54 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  31.78 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  34.43 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.6 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.62 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
885 aa  62.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
143 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.28 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.95 
 
 
211 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
143 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.4 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
143 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
143 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.67 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.21 
 
 
845 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.98 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.77 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.76 
 
 
496 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.9 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.04 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  34.19 
 
 
146 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
143 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.82 
 
 
138 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.55 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
145 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.75 
 
 
226 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
216 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 
379 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.91 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  30.82 
 
 
150 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.54 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.08 
 
 
149 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.18 
 
 
500 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
208 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  27.53 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0819  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.18 
 
 
500 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  31.41 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.42 
 
 
688 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.83 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  33.75 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  25.57 
 
 
384 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.51 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
689 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.04 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.88 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
153 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0857  CBS  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  27.08 
 
 
147 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
859 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  27.08 
 
 
147 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.04 
 
 
124 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.2 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  27.76 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  27.24 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.9 
 
 
153 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.69 
 
 
155 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
873 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  33.9 
 
 
153 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>