More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0532 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  100 
 
 		 375 aa  742    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  52.41 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  28.19 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.46 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.83 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  21.47 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.64 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  23.5 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  27.64 
 
 		 412 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 258 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  20.75 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  22.05 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  28.15 
 
 		 258 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  19.29 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.31 
 
 		 769 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 873 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  37.29 
 
 		 859 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  26.88 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.15 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.11 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.11 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.37 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 877 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  36.96 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 232 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.59 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.37 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.64 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  28.09 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.84 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.11 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 845 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.12 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.31 
 
 		 873 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.87 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  29.15 
 
 		 212 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  26.04 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.15 
 
 		 907 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.6 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  35.66 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.17 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.89 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  29.85 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  32.82 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.59 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.59 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.59 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.59 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  27.07 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.59 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.59 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  23.77 
 
 		 907 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 		 143 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  28.34 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 140 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.36 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.92 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  24.87 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.85 
 
 		 214 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.85 
 
 		 214 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  20.49 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  27.61 
 
 		 880 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.58 
 
 		 909 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  33.08 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.84 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  31.65 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.59 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.42 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>