More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3545 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  100 
 
 
411 aa  830    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  48.89 
 
 
407 aa  358  7e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  41.53 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  38.64 
 
 
381 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  39.32 
 
 
398 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  39.06 
 
 
385 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  36.91 
 
 
384 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.57 
 
 
380 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  33.33 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.32 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 
688 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.73 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  26.8 
 
 
688 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  26.58 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  27.12 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.32 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  28.64 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.2 
 
 
258 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25.95 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 
625 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  22.28 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  25.94 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  36.19 
 
 
490 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.09 
 
 
291 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  24.29 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  23.66 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  24.79 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.63 
 
 
141 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  24.88 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
215 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  21.33 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.64 
 
 
605 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  27.95 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.91 
 
 
210 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
152 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.85 
 
 
888 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  23.33 
 
 
315 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  25.73 
 
 
232 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
215 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  34.75 
 
 
141 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.11 
 
 
145 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 
863 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.55 
 
 
258 aa  56.6  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.58 
 
 
132 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  32.14 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.71 
 
 
867 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  23 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 
139 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.81 
 
 
148 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  27.44 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.07 
 
 
261 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  27.44 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.94 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.48 
 
 
219 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  26.64 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.85 
 
 
916 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  21.7 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.45 
 
 
136 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  31.74 
 
 
164 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.75 
 
 
1274 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  24.64 
 
 
153 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.72 
 
 
247 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  22.86 
 
 
250 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.94 
 
 
139 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.24 
 
 
216 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
863 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
689 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.35 
 
 
208 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  37.86 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.57 
 
 
427 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
216 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.41 
 
 
615 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  25.66 
 
 
223 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  30.91 
 
 
177 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 
873 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.55 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  28.67 
 
 
153 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  28.67 
 
 
153 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 
615 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.34 
 
 
155 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  33.93 
 
 
144 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.85 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  27.81 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.11 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 
282 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.5 
 
 
845 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.41 
 
 
615 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
615 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 
877 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.83 
 
 
139 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
149 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.85 
 
 
153 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
615 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>