More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2905 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  39.35 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  38.77 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  35.74 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  38.5 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  32.75 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  38.4 
 
 		 867 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.6 
 
 		 769 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.71 
 
 		 907 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 873 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 896 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  31.54 
 
 		 909 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  33.61 
 
 		 904 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.84 
 
 		 865 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  33.06 
 
 		 909 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.79 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.8 
 
 		 907 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.41 
 
 		 1560 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  29.52 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.79 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.85 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.04 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  31.06 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  34.62 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 845 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.74 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 885 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  31.82 
 
 		 399 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.58 
 
 		 903 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.42 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.71 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.93 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.2 
 
 		 888 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  25.84 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.09 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.53 
 
 		 1665 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  26.3 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  29.79 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  26.05 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  28 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 863 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 875 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  30.67 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.33 
 
 		 873 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  27.88 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.15 
 
 		 903 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.6 
 
 		 877 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.1 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 144 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.68 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 145 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  35.61 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.86 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.27 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.58 
 
 		 633 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.67 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  31.34 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.6 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 		 615 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  29.66 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 		 688 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.67 
 
 		 837 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.69 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  32.79 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 		 875 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 863 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  29.46 
 
 		 890 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  29.27 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 615 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  31.67 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.4 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  34.23 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>