More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1234 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
380 aa  761    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 
380 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  25.2 
 
 
385 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  24.8 
 
 
398 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.27 
 
 
399 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  23.64 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  25.19 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  24.69 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.34 
 
 
411 aa  95.9  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.32 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  25.13 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  23.33 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  25.45 
 
 
379 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  23.97 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
258 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.62 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.29 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.69 
 
 
250 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  27.92 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  28.19 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  24.03 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  27.59 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  28.49 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  26.7 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  24.12 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  32.31 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  31.05 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.95 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  23.68 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  37.61 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  35.97 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  24.81 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.16 
 
 
688 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
261 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  25.26 
 
 
279 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  26.09 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.43 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 
688 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  22.98 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.67 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  29.23 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.8 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  29.23 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.87 
 
 
236 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  27.01 
 
 
688 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
152 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
208 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
208 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 
640 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.37 
 
 
256 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.88 
 
 
191 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  33.85 
 
 
154 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.65 
 
 
210 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
145 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 
1643 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
615 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  25 
 
 
249 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  38.98 
 
 
488 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
152 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.46 
 
 
282 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  24.45 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
145 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  21.88 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
486 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
145 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 
251 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.89 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  27.07 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.06 
 
 
139 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.65 
 
 
128 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.83 
 
 
164 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.61 
 
 
769 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  35.83 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.48 
 
 
132 aa  60.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.47 
 
 
150 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  30 
 
 
174 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.68 
 
 
214 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  31.9 
 
 
202 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
615 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 
151 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.01 
 
 
220 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.94 
 
 
158 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.4 
 
 
210 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  31.15 
 
 
146 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
139 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  28.47 
 
 
142 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  31.15 
 
 
146 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
145 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>