More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1797 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  58.78 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  39.36 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  40.21 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 225 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  26.33 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  37.3 
 
 		 909 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.52 
 
 		 769 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 658 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.92 
 
 		 877 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  26.71 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  28.62 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.38 
 
 		 903 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  27.6 
 
 		 660 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 873 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 845 aa  68.9  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.59 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.54 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.67 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  29.02 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  29.02 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.54 
 
 		 909 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.16 
 
 		 903 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.33 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.12 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 		 875 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.08 
 
 		 138 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 885 aa  66.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.75 
 
 		 907 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.73 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.52 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.38 
 
 		 903 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  29.03 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.84 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  26.71 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.75 
 
 		 904 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.66 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.26 
 
 		 877 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  34.13 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  24.8 
 
 		 880 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  24.63 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.83 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.38 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  34.92 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  32.79 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  25.24 
 
 		 655 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.8 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 859 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.05 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  38.52 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 863 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.61 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.89 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 863 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.91 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  29.55 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>