More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1796 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  634    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  58.01 
 
 
313 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  55.63 
 
 
313 aa  360  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  52.75 
 
 
291 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  44.07 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  42.14 
 
 
291 aa  236  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  39.05 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  40.41 
 
 
331 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  38.22 
 
 
279 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
279 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  36.68 
 
 
279 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.6 
 
 
280 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.65 
 
 
302 aa  102  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.53 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
250 aa  96.3  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  30.73 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.62 
 
 
427 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  25.18 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  25.18 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.74 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.6 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.13 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
875 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.08 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.05 
 
 
875 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  32.5 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  22.88 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.43 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.8 
 
 
413 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.1 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  24.26 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.24 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.43 
 
 
233 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  30.25 
 
 
880 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.39 
 
 
243 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
150 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.78 
 
 
143 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  26.33 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.06 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 
143 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  25.38 
 
 
384 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  33.06 
 
 
880 aa  62.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.55 
 
 
423 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  24.32 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  27.74 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.95 
 
 
904 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.74 
 
 
147 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.79 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.68 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.5 
 
 
191 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  25.86 
 
 
845 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  29.61 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.17 
 
 
909 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
150 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
769 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  30.92 
 
 
160 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  31.39 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
873 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.43 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  26.37 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.54 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  30.36 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  31.4 
 
 
513 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.21 
 
 
907 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30.58 
 
 
513 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  25.95 
 
 
164 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  27.94 
 
 
877 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 
155 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.83 
 
 
963 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  29.13 
 
 
164 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  28.35 
 
 
163 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 
225 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  29.71 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  23.74 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  34.78 
 
 
143 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.51 
 
 
155 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  32 
 
 
875 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  24.62 
 
 
380 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
863 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  29.75 
 
 
513 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
143 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.29 
 
 
223 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
150 aa  59.7  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.12 
 
 
219 aa  59.7  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.3 
 
 
503 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  23.83 
 
 
386 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.03 
 
 
907 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  30.83 
 
 
513 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>