More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2095 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  78.26 
 
 		 163 aa  261  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  68.53 
 
 		 144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  63.89 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  63.89 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  54.86 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 		 154 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  55.24 
 
 		 146 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 153 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  54.86 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  54.86 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  54.86 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  52.78 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  54.17 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  53.85 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  53.47 
 
 		 146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  51.75 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  51.06 
 
 		 143 aa  147  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  47.22 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  46.53 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  47.92 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  45.83 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  47.22 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  46.53 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  46.53 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  48.28 
 
 		 146 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  45.14 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  46.21 
 
 		 146 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  43.66 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  47.92 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  40.97 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  46.9 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.1 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  44.68 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  43.97 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  41.26 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  42.66 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  40.97 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  48.31 
 
 		 120 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.96 
 
 		 140 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  39.73 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  41.04 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  50.98 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  41.6 
 
 		 182 aa  97.8  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.3 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  36.23 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  35.92 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.19 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.43 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  31.21 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  35.21 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  31.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.03 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  32.62 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  32.82 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  30.5 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.2 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  31.47 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.07 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.53 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  34.04 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>