More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0303 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  100 
 
 
320 aa  638    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  47.95 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  42.66 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  42.37 
 
 
313 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  42.18 
 
 
313 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  41.52 
 
 
291 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  39.15 
 
 
291 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
279 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
279 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  37.97 
 
 
279 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
279 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  32.96 
 
 
279 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
280 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  28.83 
 
 
281 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 
282 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  25.94 
 
 
302 aa  106  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.41 
 
 
280 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
250 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  27.45 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  34.27 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25.61 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.37 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.34 
 
 
166 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.09 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.3 
 
 
148 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.07 
 
 
877 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.51 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.09 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  25.17 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  25.81 
 
 
688 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.63 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 
907 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  24.36 
 
 
238 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
136 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.5 
 
 
140 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
143 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.14 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  26.87 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.04 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  25.27 
 
 
688 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  24.31 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.54 
 
 
867 aa  69.7  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.85 
 
 
769 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  24.09 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
863 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  34.35 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  23.88 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  25.27 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  25.74 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.24 
 
 
877 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 
885 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.82 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  23.53 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  33.83 
 
 
141 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.21 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  31.16 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  31.16 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.37 
 
 
903 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  26.47 
 
 
201 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  29.06 
 
 
432 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.37 
 
 
903 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.61 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  29.32 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
863 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  30.3 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.34 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  25.55 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.06 
 
 
490 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  32.88 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.54 
 
 
210 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  27.08 
 
 
147 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.43 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.43 
 
 
214 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 
135 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  27.5 
 
 
164 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.43 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>