More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0750 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  47.67 
 
 		 313 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  47.31 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  45.45 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  42.14 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  41.45 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  39.15 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  35.23 
 
 		 279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  26.34 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  26.41 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.46 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25.46 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  25.37 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.8 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.08 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.11 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.11 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.08 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  27.31 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.71 
 
 		 903 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  28.24 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.87 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.35 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  28.5 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  31.46 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 209 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.63 
 
 		 907 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  25.87 
 
 		 412 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.19 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  27.49 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  25.17 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.45 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25.6 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  28.27 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  26.3 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.06 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.82 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 		 903 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.2 
 
 		 909 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  27.59 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  25.55 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  25.78 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.79 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.47 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  26.37 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  27.5 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.37 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.38 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  27.59 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  23.24 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  27.04 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.17 
 
 		 903 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.36 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  25.5 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  27.37 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 885 aa  59.7  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3340  signal-transduction protein  23.91 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.31 
 
 		 909 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  26.49 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  38.46 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.89 
 
 		 1665 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  27.94 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  28.07 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  22.65 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  26.67 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.08 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.09 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.61 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>