More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0401 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  100 
 
 
302 aa  583  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  31.94 
 
 
331 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  28.96 
 
 
315 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.3 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  28.52 
 
 
279 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25.94 
 
 
320 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
279 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 
315 aa  102  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  26.34 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.52 
 
 
313 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  32.11 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25.36 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  40 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  40 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  39.23 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  23.36 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  38.46 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  37.69 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25.73 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.38 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  36.92 
 
 
153 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  37.4 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.31 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.84 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  35.9 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  35.9 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.1 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  22.52 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 
145 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  27.32 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  35.38 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
873 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29 
 
 
688 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  32.14 
 
 
145 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 
142 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.54 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29 
 
 
688 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  37.86 
 
 
146 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  32.41 
 
 
142 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  29.37 
 
 
146 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
153 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.62 
 
 
158 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.25 
 
 
142 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  36.54 
 
 
147 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  36.36 
 
 
188 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  38.66 
 
 
177 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1643 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 
486 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.83 
 
 
160 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.06 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.69 
 
 
269 aa  62.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  32.69 
 
 
146 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.61 
 
 
143 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  30.53 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  36.19 
 
 
146 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.89 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 
138 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.72 
 
 
209 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  33.05 
 
 
163 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  33.33 
 
 
143 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.39 
 
 
146 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.56 
 
 
491 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
144 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  25.91 
 
 
407 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  37.37 
 
 
144 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
143 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
142 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.6 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  29.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  30.28 
 
 
174 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  33.33 
 
 
141 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  32.32 
 
 
186 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 
143 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 
143 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  36.04 
 
 
142 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.12 
 
 
688 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>