More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1383 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  79.34 
 
 
272 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  74.64 
 
 
287 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  74.81 
 
 
280 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  64.41 
 
 
284 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  49.64 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  48.73 
 
 
283 aa  279  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  45.42 
 
 
283 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  35.46 
 
 
290 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  33.45 
 
 
281 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  33.8 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  32.53 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1489  CBS domain containing protein  30.88 
 
 
283 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.87 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.07 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  42.73 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.29 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  40.18 
 
 
512 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  29.73 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.62 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.47 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  31.97 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  44.14 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.58 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.9 
 
 
859 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.58 
 
 
139 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.46 
 
 
139 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.34 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.43 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
141 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.23 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.57 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
867 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.58 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.5 
 
 
875 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.81 
 
 
865 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.44 
 
 
769 aa  72.4  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  36.21 
 
 
598 aa  72.4  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  41.13 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  26.67 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
688 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  37.39 
 
 
877 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.25 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.7 
 
 
139 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.88 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  37.93 
 
 
688 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.33 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  40.32 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.48 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.25 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  28.25 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  28.24 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  30.7 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  28.45 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.19 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.6 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  31.08 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.26 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  26.7 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.47 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.76 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.62 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.58 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  24.69 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.58 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.58 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  27.71 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  37.84 
 
 
863 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.65 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.71 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.61 
 
 
153 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 
252 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.33 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  33.65 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  33.58 
 
 
907 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35.71 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  23.72 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.82 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  35 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>