More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0310 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  64.41 
 
 
282 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  64.41 
 
 
287 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  63.37 
 
 
272 aa  360  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  62.04 
 
 
280 aa  348  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  46.26 
 
 
283 aa  268  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  46.26 
 
 
302 aa  254  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  42.35 
 
 
283 aa  227  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  31.41 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  31.94 
 
 
283 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
284 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0294  putative signal transduction protein with CBS domains  33.8 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0293568  normal  0.263236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0795  CBS domain containing protein  31.69 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1489  CBS domain containing protein  31.6 
 
 
283 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.69 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.58 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.72 
 
 
859 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  34.19 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.25 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.26 
 
 
875 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.39 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  38.14 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.59 
 
 
769 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.1 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  29.17 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.65 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  23.25 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.94 
 
 
877 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.8 
 
 
863 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  34.78 
 
 
598 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  34.13 
 
 
148 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.09 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.82 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.87 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  29.78 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.29 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  37.5 
 
 
688 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
903 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  28.03 
 
 
859 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
688 aa  65.9  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.9 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.9 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.9 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.9 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.75 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  35.38 
 
 
188 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.65 
 
 
488 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 
135 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  33.33 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  31.45 
 
 
148 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.09 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.9 
 
 
145 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
143 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  34.9 
 
 
186 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
154 aa  62.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  28.57 
 
 
879 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.68 
 
 
150 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  29.8 
 
 
242 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.71 
 
 
423 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  28.57 
 
 
879 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.08 
 
 
185 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.77 
 
 
880 aa  62.4  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.59 
 
 
291 aa  62.4  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  33.06 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
120 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.21 
 
 
488 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
120 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  27.22 
 
 
904 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  33.33 
 
 
909 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.17 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 
141 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  30 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  30 
 
 
163 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.17 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  31.67 
 
 
202 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.87 
 
 
903 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  34.44 
 
 
186 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.8 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
161 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.28 
 
 
489 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
148 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  29.72 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
141 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>