More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0126 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0126  CBS  100 
 
 
148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  88.51 
 
 
148 aa  280  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  86.49 
 
 
148 aa  280  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  87.16 
 
 
150 aa  278  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  87.84 
 
 
148 aa  278  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  88.51 
 
 
148 aa  277  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  85.14 
 
 
148 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  52.86 
 
 
147 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  43.33 
 
 
208 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 
199 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  38.4 
 
 
208 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 
204 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  37.6 
 
 
203 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
197 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  37.9 
 
 
208 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  37.9 
 
 
208 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  31.34 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  39.2 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  33.06 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  34.13 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  30.33 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  29.77 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  30.47 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  30.77 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  31.93 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  31.09 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  25.95 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  31.25 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  25.95 
 
 
213 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.51 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.36 
 
 
586 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  33.06 
 
 
284 aa  62  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.15 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.07 
 
 
897 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
207 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  26.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.7 
 
 
282 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.34 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  27.91 
 
 
863 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  30.4 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  32.73 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.57 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.85 
 
 
688 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  23.85 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.09 
 
 
606 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.43 
 
 
626 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  30.3 
 
 
641 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
688 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.69 
 
 
598 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  29.2 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  30.36 
 
 
601 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  32.77 
 
 
626 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.91 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.85 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.08 
 
 
188 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 
625 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  27.87 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  30.89 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  29.91 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
615 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.77 
 
 
600 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  30.17 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  28.57 
 
 
615 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  32.76 
 
 
324 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  32.76 
 
 
324 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.27 
 
 
626 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
615 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
200 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  27.35 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  28.57 
 
 
615 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  32.38 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 
605 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  23.81 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  29.13 
 
 
633 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.41 
 
 
582 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  30.91 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  29.63 
 
 
637 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  27.92 
 
 
160 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
154 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  29.47 
 
 
217 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 
618 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
292 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
206 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  27.74 
 
 
627 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
154 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>