More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0784 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  91.39 
 
 		 213 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.42 
 
 		 586 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.41 
 
 		 600 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  37.72 
 
 		 589 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.15 
 
 		 845 aa  79  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  34.33 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.24 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.6 
 
 		 769 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  27.48 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  33.05 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 		 600 aa  72  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  32.76 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  29.01 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.35 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.17 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35.45 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  29.06 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  25.95 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  29.03 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  26.05 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  29.31 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  33.07 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.75 
 
 		 1560 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 134 aa  62  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 606 aa  61.6  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  34.56 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.41 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.36 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  31.58 
 
 		 601 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.81 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1274 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.46 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.72 
 
 		 633 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  30.43 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 		 645 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  31.71 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.68 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.31 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  27.27 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.45 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.03 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  33.61 
 
 		 606 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 603 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>