117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1950 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  58.54 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  55.91 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  56.8 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  56.25 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  55.65 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  56.56 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  54.84 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  51.61 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  37.7 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  39.67 
 
 		 208 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  39.67 
 
 		 208 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 199 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  37.7 
 
 		 208 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  37.7 
 
 		 208 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 204 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  36.67 
 
 		 203 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 		 197 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  32.74 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  30.77 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  29.06 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  32.71 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  28.04 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  25.21 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  28.07 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  27.19 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  32.32 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  28.71 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.7 
 
 		 586 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  27.45 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.85 
 
 		 600 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35.92 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.19 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  30.23 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  27.45 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  27.1 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  28.23 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  30.1 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.19 
 
 		 589 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  29.84 
 
 		 487 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  33.01 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  26.92 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  28.16 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  28.16 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  26.47 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.21 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  30.1 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  28.16 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  26.92 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  26.19 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.81 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  33.75 
 
 		 260 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  27.62 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  25.49 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  25.41 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  24.19 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  28.12 
 
 		 268 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  27.45 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  26.47 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  25.27 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  34.62 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.67 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  28.95 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  35.19 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  23.97 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  29.11 
 
 		 104 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  28.16 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  26.17 
 
 		 627 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  26.47 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.67 
 
 		 613 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>