264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0307 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  53.9 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  53.9 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  52.86 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  51.77 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  52.86 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  51.43 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  52.86 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 		 197 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 199 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  38.84 
 
 		 208 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  39.83 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  37.6 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  38.79 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  35.61 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  35.43 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  36 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  32.81 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  30.83 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.35 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.48 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.92 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.58 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 605 aa  57  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.58 
 
 		 586 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  33.02 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.57 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  29.03 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.26 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  29.51 
 
 		 629 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 208 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  29.6 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.93 
 
 		 426 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.87 
 
 		 614 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  32.28 
 
 		 480 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  30.66 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 		 624 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  27.78 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  25.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.65 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.27 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.95 
 
 		 589 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  28.79 
 
 		 284 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  25.2 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  34.35 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  30.17 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  32.58 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  31.09 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  22.88 
 
 		 486 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  33.98 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  28.35 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  27.08 
 
 		 320 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  25.98 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.17 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.33 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  32 
 
 		 512 aa  48.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  26.56 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  24.48 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>