267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0715 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  100 
 
 
128 aa  254  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  94.44 
 
 
126 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1747  signal transduction protein  94.44 
 
 
126 aa  239  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  66.67 
 
 
127 aa  184  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  48.06 
 
 
132 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.79 
 
 
211 aa  60.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.89 
 
 
222 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.34 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  30.08 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
256 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  29.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  27.2 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  28.46 
 
 
209 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
197 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
211 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  27.07 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  30.47 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  23.13 
 
 
282 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.61 
 
 
589 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 
300 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  28.99 
 
 
426 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.23 
 
 
586 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.01 
 
 
302 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1169  CBS domain-containing protein  25.4 
 
 
214 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.137259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  29.71 
 
 
398 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  42.59 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.66 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  24.59 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 
162 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.92 
 
 
877 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  24.81 
 
 
212 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
147 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  24.39 
 
 
867 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  32.58 
 
 
637 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  22.05 
 
 
258 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  28.79 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.5 
 
 
185 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  27.34 
 
 
279 aa  50.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
211 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.91 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  28.15 
 
 
212 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  27.5 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  26.19 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  29.41 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.91 
 
 
295 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  25.21 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  25.98 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  26.32 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  23.88 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.58 
 
 
880 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  27.54 
 
 
385 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  24.81 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
1122 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  23.26 
 
 
261 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  29.01 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  27.69 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  24 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  32.54 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  23.48 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  27.48 
 
 
137 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  31.54 
 
 
629 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25 
 
 
320 aa  47.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  25.81 
 
 
274 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  40.35 
 
 
286 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 
625 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  24.22 
 
 
227 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  25 
 
 
208 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  26.36 
 
 
215 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  29.13 
 
 
126 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  28.46 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
620 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  23.2 
 
 
281 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.86 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.72 
 
 
291 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  29.84 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  31.71 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  26.12 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>