260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1481 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  45.76 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  35.23 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.18 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  29.35 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  25.39 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.24 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  26.19 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  22.58 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  22.5 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.31 
 
 		 837 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 		 148 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 		 907 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  24.01 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  31.71 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.12 
 
 		 903 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  28.97 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  24.29 
 
 		 128 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 		 903 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  23.13 
 
 		 128 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1747  signal transduction protein  22.45 
 
 		 126 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  20.53 
 
 		 427 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.55 
 
 		 909 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 152 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.94 
 
 		 165 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.33 
 
 		 904 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.83 
 
 		 140 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 158 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 		 903 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  26.78 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 140 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  27.83 
 
 		 613 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.37 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.67 
 
 		 840 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  28.1 
 
 		 626 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 615 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  22.51 
 
 		 1560 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  30.08 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  40 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 		 159 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.05 
 
 		 605 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.28 
 
 		 148 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.5 
 
 		 909 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  22.26 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  22.15 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  27.41 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.18 
 
 		 615 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  29.17 
 
 		 126 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  31.4 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.81 
 
 		 1274 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 		 141 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 		 141 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 152 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.24 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  25.22 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  23.94 
 
 		 411 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  23.72 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  28.7 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  18.49 
 
 		 963 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 615 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  25.2 
 
 		 845 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  26.26 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  31.48 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  28.7 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.47 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  23.29 
 
 		 867 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  25.83 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  20.93 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  25.47 
 
 		 574 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  24.58 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  29.27 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 151 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>