225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2904 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  53.28 
 
 
258 aa  286  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  49.8 
 
 
260 aa  266  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  47.49 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  42.47 
 
 
257 aa  223  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
258 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  28.35 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  30.68 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  38.71 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  23.57 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
386 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  28.46 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 
140 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  26.02 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  31.13 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.58 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.09 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  45.45 
 
 
128 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
873 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  24.41 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  44.44 
 
 
348 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  48.15 
 
 
128 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  54.9 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  22.46 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 
215 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  22.13 
 
 
375 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  26.99 
 
 
867 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.27 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  34.74 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  32.35 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  30.36 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  40.38 
 
 
149 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.65 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 
120 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
134 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.69 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  22.22 
 
 
426 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  31.73 
 
 
163 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.23 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.18 
 
 
885 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  33.33 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.08 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  32.69 
 
 
153 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  29.28 
 
 
381 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
133 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  27.88 
 
 
214 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 
688 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  35.29 
 
 
333 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  30.63 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.93 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.53 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
145 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  41.51 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  28.45 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  25.58 
 
 
133 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  28.85 
 
 
146 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  46.81 
 
 
888 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.13 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 
431 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  43.14 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  26.32 
 
 
907 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.47 
 
 
880 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.25 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  28.09 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  28 
 
 
232 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  37.25 
 
 
888 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.52 
 
 
145 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.26 
 
 
845 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
241 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.53 
 
 
191 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.85 
 
 
862 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  30.61 
 
 
143 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.4 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  26.09 
 
 
158 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  25.26 
 
 
909 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  25 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>