More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0506 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 133 aa  264  4e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  30.7 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 688 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 		 600 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  28.83 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  25.41 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.2 
 
 		 688 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  27.12 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0970  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.374619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  27.52 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 613 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  29.81 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 		 628 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  24.41 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30.48 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  26.13 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  27.05 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  30.7 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  25.96 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  30.84 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  24.41 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 625 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  29.09 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  23.42 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  27.43 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.38 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  33.7 
 
 		 689 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  25.38 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  26.83 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 624 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  30.58 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  26.56 
 
 		 637 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.93 
 
 		 598 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  29.06 
 
 		 413 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  26.09 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  26.09 
 
 		 641 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2491  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 574 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  26.02 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  31.62 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  24.32 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 675 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  27.68 
 
 		 646 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  26.79 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  22.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  24.27 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  22.61 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  24.75 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.75 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3147  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00650637  normal  0.0214142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  25.81 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 623 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2958  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  23.39 
 
 		 639 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3024  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.28 
 
 		 606 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3040  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 321 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  28.21 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  26.79 
 
 		 625 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2989  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15084  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 		 618 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 324 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 324 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  26.13 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 615 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  26.23 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  21.26 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.7 
 
 		 500 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.36 
 
 		 907 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  27.64 
 
 		 300 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  31.82 
 
 		 437 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  23.48 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  25.58 
 
 		 259 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  30.17 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.16 
 
 		 636 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  28.46 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 		 615 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  22.32 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.86 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>