23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0970 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0970  signal-transduction protein  100 
 
 		 125 aa  247  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.374619 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  33.64 
 
 		 888 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  32.32 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 667 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 648 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  32 
 
 		 875 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2287  CBS domain containing protein  32.67 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  33.78 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  29.58 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  28.97 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.38 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30 
 
 		 649 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  32 
 
 		 875 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0317  putative signal transduction protein with CBS domains  29.21 
 
 		 730 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  27.55 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 649 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.19 
 
 		 873 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.26 
 
 		 907 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  27.85 
 
 		 385 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>