108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2669 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  59.54 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  55.95 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  48.45 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  47.49 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  30.35 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  37.63 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  29.81 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  24.53 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  33.58 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  25.32 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  22.03 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  25.6 
 
 		 380 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  27.78 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  25.77 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  27.5 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  24.82 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  23.73 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  43.4 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.6 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  21.65 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  30.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 		 863 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.07 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  49.09 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  29.75 
 
 		 897 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  20.07 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  24.42 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  24.69 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 873 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.38 
 
 		 411 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  25.29 
 
 		 412 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.63 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  24.7 
 
 		 537 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 148 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  43.64 
 
 		 120 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  26.38 
 
 		 413 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  27.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  25.69 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  30.21 
 
 		 859 aa  45.8  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 		 885 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.29 
 
 		 413 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  40 
 
 		 769 aa  45.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 230 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  26.76 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  40.38 
 
 		 881 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 133 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  30.7 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  23.67 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  29.53 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  25.86 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  22.76 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  26.61 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 158 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  38.89 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  30.17 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  25.98 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.88 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  22.84 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  26.83 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  28.1 
 
 		 880 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  33.73 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  23.49 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.17 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  29.7 
 
 		 142 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  30.09 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  23.12 
 
 		 888 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  40 
 
 		 433 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.75 
 
 		 821 aa  42.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  40.38 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  23.39 
 
 		 437 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>