More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2169 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  100 
 
 
449 aa  899    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  42.55 
 
 
450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  39.04 
 
 
445 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  38.32 
 
 
444 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  43.22 
 
 
445 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  40.43 
 
 
484 aa  292  9e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  37.53 
 
 
473 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  38.31 
 
 
462 aa  279  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.96 
 
 
479 aa  279  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  35.78 
 
 
451 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  35.32 
 
 
481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.43 
 
 
450 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  36.05 
 
 
444 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  34.93 
 
 
542 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  36.05 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  34.23 
 
 
485 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  37.29 
 
 
471 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  33.72 
 
 
452 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.73 
 
 
476 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  31.55 
 
 
461 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  31.55 
 
 
461 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  36.34 
 
 
473 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  36.02 
 
 
463 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.25 
 
 
461 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  35.45 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  34.91 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.85 
 
 
462 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  34.32 
 
 
470 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.8 
 
 
460 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  35.82 
 
 
422 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  38.24 
 
 
473 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  37.1 
 
 
473 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  37.91 
 
 
473 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  36.58 
 
 
472 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  31.26 
 
 
451 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.14 
 
 
449 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  35.53 
 
 
470 aa  247  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  33.8 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.39 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  31.7 
 
 
450 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  35.47 
 
 
461 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  33.41 
 
 
456 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  33.49 
 
 
481 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3735  MgtE integral membrane region  36.94 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  35.8 
 
 
454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  30.99 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  35.57 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  32.63 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  31.46 
 
 
480 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  32.01 
 
 
482 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  32.01 
 
 
482 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  36.04 
 
 
467 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.17 
 
 
454 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  30.75 
 
 
480 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  32.4 
 
 
454 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  31.69 
 
 
480 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  30.75 
 
 
480 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  33.56 
 
 
453 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  32.4 
 
 
454 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  32.4 
 
 
454 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.93 
 
 
454 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  32.2 
 
 
452 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  31.93 
 
 
454 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  31.93 
 
 
454 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  30.99 
 
 
480 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  30.99 
 
 
480 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  31.7 
 
 
454 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  30.75 
 
 
480 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  34.69 
 
 
455 aa  229  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  35.1 
 
 
453 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  30.77 
 
 
454 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  34.1 
 
 
450 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  30.99 
 
 
480 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  31.31 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  31.93 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  33.26 
 
 
454 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.59 
 
 
450 aa  226  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  31.47 
 
 
454 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  34.02 
 
 
453 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  30.73 
 
 
450 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  30.84 
 
 
455 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.63 
 
 
471 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  30.68 
 
 
479 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.35 
 
 
454 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  30.93 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  30.25 
 
 
452 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  35.39 
 
 
471 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.58 
 
 
442 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  32.48 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  29.27 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  30.87 
 
 
451 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  30.42 
 
 
453 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  33.33 
 
 
494 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  33.41 
 
 
453 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  32.74 
 
 
450 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  30.65 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  30.68 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.83 
 
 
458 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  30.65 
 
 
452 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  30.99 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>