More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2778 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  100 
 
 		 461 aa  907    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  56.08 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  55.35 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  57.58 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  56.91 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  57.35 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  54.19 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  53.91 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  54.03 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  50.77 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  56.56 
 
 		 470 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  51.02 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  51.48 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  51.48 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  51.47 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  48.7 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  51.03 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  49.12 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  49.89 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  49.2 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  50.48 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  50.99 
 
 		 473 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  51.49 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  51.06 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  51.03 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  50.77 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  47.36 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  34.15 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  34.7 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  32.74 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  38.44 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  39.21 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  38.68 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.74 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  38.06 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  38.06 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  39.77 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  38.06 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  37.21 
 
 		 480 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  37.67 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  36.56 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  37.26 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  37.09 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  38.21 
 
 		 478 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  38.13 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.04 
 
 		 453 aa  272  8.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  38.04 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  37.89 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.37 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  37.89 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  36.47 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  38.61 
 
 		 477 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  38.13 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.61 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  37.41 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  36.85 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  35.08 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  36.94 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  38.15 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  39 
 
 		 479 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  37.56 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  37.53 
 
 		 422 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  41 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  36.96 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  36.96 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  35.86 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  39.17 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.74 
 
 		 454 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  36.08 
 
 		 452 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  36.07 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  37.76 
 
 		 480 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  37.03 
 
 		 454 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  38.74 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  37.5 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0465  magnesium transporter  35.77 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  37.89 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  37.99 
 
 		 494 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.97 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  34.47 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  38.03 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  37.27 
 
 		 454 aa  247  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  36.79 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.02 
 
 		 475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  37.03 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  36.77 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  36.66 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  35.12 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  34.05 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.27 
 
 		 451 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  34.23 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  37.26 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  37.44 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  35.92 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  37.27 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.34 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>