More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3382 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  82.14 
 
 		 454 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  82.37 
 
 		 454 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  81.04 
 
 		 454 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  82.14 
 
 		 454 aa  751    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  82.14 
 
 		 454 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  78.68 
 
 		 455 aa  737    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  79.3 
 
 		 454 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  79.07 
 
 		 454 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  100 
 
 		 454 aa  915    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  750    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  79.3 
 
 		 454 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  74.23 
 
 		 454 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  80.18 
 
 		 454 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  78.63 
 
 		 454 aa  728    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  61.69 
 
 		 453 aa  581  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  62.79 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  61.47 
 
 		 452 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  61.69 
 
 		 451 aa  544  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  60.44 
 
 		 451 aa  532  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  57.78 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  56.01 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  59.69 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  51.67 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  51.7 
 
 		 450 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  51.24 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  51.25 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  50 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  50.12 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  46.56 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  46.14 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  45.89 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  42.12 
 
 		 480 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  41.94 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  43.63 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  40.18 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  39.95 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  40.81 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  40.81 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  40.78 
 
 		 480 aa  329  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  40.55 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  40.81 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  39.26 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  43.3 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  40.32 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  41.36 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  41.36 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  39.26 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  37.35 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  37.35 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  37.35 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.65 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.89 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  40.09 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  38.95 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  38.41 
 
 		 481 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  39.72 
 
 		 478 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.44 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  37.29 
 
 		 492 aa  286  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.79 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  37.59 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  36.8 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  37.64 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  35.8 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  37.17 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.91 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  37.68 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.78 
 
 		 456 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.07 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.78 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35.55 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  34.45 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.8 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.31 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  35.96 
 
 		 462 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.92 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.68 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  36.23 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  36.17 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  34.68 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  35.46 
 
 		 472 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  36.32 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.07 
 
 		 459 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.07 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.07 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  34.45 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.07 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.07 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.07 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.73 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  34.6 
 
 		 485 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35.57 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.6 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.32 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  32.12 
 
 		 473 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.5 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  33.57 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  34.48 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.84 
 
 		 471 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>