More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1994 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  100 
 
 		 442 aa  885    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  53.1 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  51.59 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  51.46 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  48.09 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  44.07 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  40.51 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  40.79 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  38.48 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  38.13 
 
 		 462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.1 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  35.33 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.87 
 
 		 480 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.87 
 
 		 480 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  39.01 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  34.64 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  33.49 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  34.88 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.86 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.91 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  36.74 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  33.26 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  35.85 
 
 		 492 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  36.98 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  36.74 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  35.58 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  36.74 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.18 
 
 		 480 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  35.41 
 
 		 454 aa  259  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  36.28 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  38 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.74 
 
 		 454 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.6 
 
 		 481 aa  255  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  34.79 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  35.7 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.35 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.35 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  34.42 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.35 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  35.73 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  36.28 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.91 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.88 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  33.41 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.59 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  33.41 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  33.41 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.92 
 
 		 473 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.95 
 
 		 452 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  36.64 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  35.46 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  33.79 
 
 		 482 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  33.79 
 
 		 482 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  35.2 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  33.72 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  35.35 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  34.64 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  34.97 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.27 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.57 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  34.87 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  35.56 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.96 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  34.33 
 
 		 481 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  33.33 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.09 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.34 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.56 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  34.57 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.56 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  34.4 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.43 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  37.21 
 
 		 471 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  36.74 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  33.64 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  39.31 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  34.05 
 
 		 475 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  36.41 
 
 		 472 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  33.41 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  36.62 
 
 		 473 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  36.81 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.2 
 
 		 494 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  33.03 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  33.57 
 
 		 445 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  33.87 
 
 		 479 aa  226  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  33.87 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  37 
 
 		 473 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  34.27 
 
 		 452 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  32.71 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  32.71 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  33.64 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  32.35 
 
 		 456 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  33.95 
 
 		 451 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.55 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  32.87 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  32.48 
 
 		 456 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  31.28 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  36.61 
 
 		 484 aa  217  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  34.26 
 
 		 451 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>