More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03669 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  895    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  96.9 
 
 
452 aa  847    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  91.57 
 
 
453 aa  807    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  80.49 
 
 
451 aa  697    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  62.58 
 
 
454 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  62.05 
 
 
454 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  62.22 
 
 
455 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  61.69 
 
 
454 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  62.05 
 
 
454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  61.17 
 
 
454 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  61.17 
 
 
454 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  61.17 
 
 
454 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  61.17 
 
 
454 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  59.65 
 
 
453 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  60.31 
 
 
454 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  60 
 
 
454 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  60.09 
 
 
454 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  60.09 
 
 
454 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  59.87 
 
 
454 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  60.54 
 
 
454 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  56.76 
 
 
452 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  54.99 
 
 
452 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  58.76 
 
 
452 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  51.22 
 
 
453 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  50.68 
 
 
450 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  48.57 
 
 
450 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  47.67 
 
 
453 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  49.67 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  49.28 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  50.79 
 
 
455 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  44.32 
 
 
453 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  43.82 
 
 
453 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  40.84 
 
 
480 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  42.73 
 
 
479 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  42.34 
 
 
480 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  42.34 
 
 
480 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  40.22 
 
 
480 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  40.62 
 
 
480 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  41.72 
 
 
482 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  40.17 
 
 
480 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  41.72 
 
 
482 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  41.5 
 
 
480 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  41.78 
 
 
480 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  42.39 
 
 
480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  43.78 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  40.53 
 
 
492 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  40.54 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  39.31 
 
 
480 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.9 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  37.5 
 
 
491 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  37.5 
 
 
491 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  37.5 
 
 
491 aa  319  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  40.62 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  37.02 
 
 
478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  38.48 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  35.43 
 
 
481 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.1 
 
 
471 aa  289  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  37.86 
 
 
476 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  35.73 
 
 
446 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  35.82 
 
 
492 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  36.06 
 
 
492 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  39.34 
 
 
463 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  38.28 
 
 
478 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.71 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.06 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  35.7 
 
 
443 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.47 
 
 
481 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  37.59 
 
 
467 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  39.32 
 
 
462 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.49 
 
 
471 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  36.09 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  36.09 
 
 
459 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  37.92 
 
 
461 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  36.45 
 
 
479 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  33.71 
 
 
456 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  35.8 
 
 
454 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  36.28 
 
 
465 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  33.48 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  33.49 
 
 
456 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  36.49 
 
 
473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.21 
 
 
484 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.24 
 
 
458 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  36.73 
 
 
471 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  33.03 
 
 
456 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  34.52 
 
 
485 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35.5 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.03 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  36.34 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  34.17 
 
 
456 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  34.17 
 
 
456 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  34.17 
 
 
456 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  34.17 
 
 
456 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  33.71 
 
 
448 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.78 
 
 
471 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  37.14 
 
 
459 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  34.98 
 
 
462 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  32.79 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.29 
 
 
451 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  37.44 
 
 
473 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  34.43 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>