297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0262 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  100 
 
 		 445 aa  886    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  68.28 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  60.99 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  54.85 
 
 		 443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  48.29 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  49.64 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  48.78 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  48.78 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  48.43 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  48.54 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  49.27 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  47.32 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  43.94 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  46.83 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  49.15 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  49.15 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  49.15 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  49.15 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  49.02 
 
 		 472 aa  362  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  44.44 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  43.37 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  44.01 
 
 		 448 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  43.24 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  42.09 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  38.19 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  37.67 
 
 		 480 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  37.89 
 
 		 480 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39.42 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  38.57 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  38.41 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  36.96 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  39.76 
 
 		 452 aa  289  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  37.53 
 
 		 480 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  36.88 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  39.86 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  38 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  38 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  38.85 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  38 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.14 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  39.42 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.28 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.28 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.62 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  35.51 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  38.48 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  39.23 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  36.04 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  38.11 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  35.53 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  40.49 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  38.32 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  36.23 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.94 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  35.29 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  35.84 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  35.84 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  35.84 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.38 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  35.59 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  35.92 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  34.87 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  34.87 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.51 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  34.87 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  34.38 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.62 
 
 		 454 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  35.62 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  35.59 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  33.71 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  34.7 
 
 		 453 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  34.93 
 
 		 451 aa  257  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  35.84 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  38.37 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  36.04 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  35 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  32.85 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  32.85 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  32.85 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  35.61 
 
 		 477 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  35.01 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  35.27 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  35.53 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  35.81 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  34.54 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  35.42 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  33.18 
 
 		 442 aa  222  9e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.48 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.22 
 
 		 478 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  33.79 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  33.17 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  33.5 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.13 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  34.92 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  30.79 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.76 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  34.73 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.24 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.33 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  32.54 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>