More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3545 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  78.69 
 
 
491 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  100 
 
 
477 aa  957    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  78.69 
 
 
491 aa  759    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  78.69 
 
 
491 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  66.46 
 
 
492 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  70.74 
 
 
492 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  63.39 
 
 
478 aa  604  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  57.08 
 
 
480 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  57.86 
 
 
480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  55.15 
 
 
480 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  55.04 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  54.72 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  55.04 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  55.04 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  54.72 
 
 
480 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  53.85 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  53.85 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  54.8 
 
 
480 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  51.67 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  50.21 
 
 
479 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  52.06 
 
 
494 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  50.54 
 
 
481 aa  435  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  51.36 
 
 
478 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  51.19 
 
 
481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  40.24 
 
 
453 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  41.11 
 
 
450 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  38.72 
 
 
455 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39.67 
 
 
422 aa  319  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  40.14 
 
 
453 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  38.95 
 
 
454 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  37.44 
 
 
454 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  41.2 
 
 
450 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  42.24 
 
 
452 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  39.05 
 
 
453 aa  315  9e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  37.67 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  37.21 
 
 
454 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  37.21 
 
 
454 aa  309  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.39 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  36.21 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  37.88 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  37.88 
 
 
454 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  37.41 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  37.41 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  37.65 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  37.41 
 
 
454 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  37.53 
 
 
454 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  38.48 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  37.65 
 
 
454 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  38.41 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  38.48 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  39.77 
 
 
453 aa  302  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  37.95 
 
 
453 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  39.95 
 
 
473 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  37.7 
 
 
451 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  39.71 
 
 
471 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  38.26 
 
 
471 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  38.28 
 
 
453 aa  293  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.98 
 
 
471 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  39.23 
 
 
471 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.77 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.14 
 
 
452 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  37.47 
 
 
471 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  36.74 
 
 
470 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  35 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  36.54 
 
 
475 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.6 
 
 
492 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  37.2 
 
 
481 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.46 
 
 
476 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  37.47 
 
 
455 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.06 
 
 
461 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.37 
 
 
445 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  34.88 
 
 
442 aa  259  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  36.9 
 
 
470 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  33.56 
 
 
484 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  34.53 
 
 
473 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  34.11 
 
 
445 aa  256  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  33.33 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  33.33 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.4 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.7 
 
 
482 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  36.9 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  33.26 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  33.11 
 
 
456 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  36.16 
 
 
473 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.58 
 
 
479 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  33.11 
 
 
456 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  35.36 
 
 
465 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  33.71 
 
 
455 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  34.22 
 
 
467 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  36.19 
 
 
473 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  33.49 
 
 
456 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  33.49 
 
 
456 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  33.49 
 
 
456 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  33.49 
 
 
456 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  33.56 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  36.19 
 
 
473 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  33.64 
 
 
454 aa  243  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  34.67 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.96 
 
 
459 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>