More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3340 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  82.97 
 
 		 473 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  80.97 
 
 		 473 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  100 
 
 		 473 aa  924    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  82.66 
 
 		 473 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  81.7 
 
 		 472 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  63 
 
 		 470 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  60.35 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  59.65 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  53.72 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  55.9 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  57.24 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  56.8 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  55.26 
 
 		 471 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  51.47 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  51.66 
 
 		 476 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  52.07 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  46.71 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  47.71 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  45.09 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  49.53 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  47.15 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  47.52 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  45.14 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  43.95 
 
 		 479 aa  359  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  43.88 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  47.53 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  44.59 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  42.08 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  40.67 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.39 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  38.61 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  38.37 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  35.93 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  37.35 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  35.7 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  35.93 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  35.46 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  38.55 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  36.34 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  37.33 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  36.56 
 
 		 479 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  39.28 
 
 		 494 aa  270  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.7 
 
 		 480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.93 
 
 		 480 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.46 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.46 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  33.93 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  33.78 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  33.78 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  38.64 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.03 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  36 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  36 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  31.44 
 
 		 456 aa  260  5.0000000000000005e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  33.33 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  33.33 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  33.33 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.64 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.85 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  36.41 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31.86 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31.64 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31.42 
 
 		 454 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.1 
 
 		 454 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.1 
 
 		 454 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  35.22 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  37.02 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  36.87 
 
 		 542 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.56 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  36.51 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  34.79 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  34.76 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.92 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.53 
 
 		 477 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  30.97 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  32.12 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  31.19 
 
 		 454 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.01 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  36.49 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  37.69 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  34.33 
 
 		 453 aa  247  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  35.06 
 
 		 451 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  36.02 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  31.35 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.73 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  34.29 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  37.78 
 
 		 475 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  34.75 
 
 		 492 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  33.33 
 
 		 461 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  33.71 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  35 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  29.87 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  36.86 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.08 
 
 		 450 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  33.81 
 
 		 492 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  32.49 
 
 		 481 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.21 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  33.97 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>