More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02217 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  100 
 
 
422 aa  828    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  83.61 
 
 
453 aa  685    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  51.31 
 
 
454 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  51.07 
 
 
454 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  51.07 
 
 
454 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  51.07 
 
 
454 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  50.12 
 
 
454 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  51.07 
 
 
454 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  50.59 
 
 
454 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  50.59 
 
 
454 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  50.59 
 
 
454 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  50.83 
 
 
454 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  48.46 
 
 
454 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  50.12 
 
 
454 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  47.86 
 
 
453 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  50.6 
 
 
453 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  49.29 
 
 
455 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  47.27 
 
 
454 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  47.96 
 
 
452 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  50.24 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  51.31 
 
 
452 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  49.17 
 
 
479 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  47.75 
 
 
450 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  49.28 
 
 
451 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  48.69 
 
 
453 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  50.49 
 
 
450 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  48.32 
 
 
452 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  51.06 
 
 
480 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  49.41 
 
 
454 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  47.62 
 
 
480 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  46.9 
 
 
480 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  44.66 
 
 
452 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  46.9 
 
 
480 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  50.25 
 
 
452 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  47 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  47 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  45.95 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  47.97 
 
 
482 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  46.67 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  47.97 
 
 
482 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  47.51 
 
 
480 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  46.19 
 
 
451 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  47.38 
 
 
481 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  44.76 
 
 
453 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  45.95 
 
 
481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  48.18 
 
 
494 aa  362  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  48.1 
 
 
480 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  48.57 
 
 
455 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  45.61 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  40.86 
 
 
491 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  40.86 
 
 
491 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  40.86 
 
 
491 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  41.57 
 
 
443 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  43.94 
 
 
451 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  43.84 
 
 
475 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  39.81 
 
 
478 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  40.19 
 
 
492 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  39.81 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  39.67 
 
 
477 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  38.61 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  39.28 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  40.67 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  41.87 
 
 
481 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  39.86 
 
 
463 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  39.67 
 
 
462 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  39.43 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  39.18 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  39.43 
 
 
459 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.63 
 
 
476 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  39.52 
 
 
458 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  39.18 
 
 
467 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  38.7 
 
 
467 aa  280  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  37.53 
 
 
456 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  40.91 
 
 
471 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  37.29 
 
 
456 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  37.29 
 
 
456 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  37.29 
 
 
456 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  39.18 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  38.16 
 
 
485 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  40.38 
 
 
459 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  39.09 
 
 
479 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  39.33 
 
 
472 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.43 
 
 
481 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  38.06 
 
 
445 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  38.31 
 
 
454 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  37.53 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  36.58 
 
 
484 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  39.71 
 
 
473 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  38.42 
 
 
445 aa  266  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  35.9 
 
 
473 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  36.43 
 
 
470 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  37.98 
 
 
471 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  34.69 
 
 
448 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  34.88 
 
 
442 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  36.82 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  36.82 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  36.82 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  36.82 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  36.72 
 
 
455 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  39 
 
 
473 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>