292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0416 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  74.11 
 
 		 448 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  72.54 
 
 		 448 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  70.98 
 
 		 448 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  100 
 
 		 448 aa  894    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  46.31 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  46.64 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  45.74 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  44.84 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  45.07 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  45.07 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  46.31 
 
 		 484 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  43.38 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  45.07 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  45.07 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  45.07 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  45.07 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  43.38 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  43.79 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 		 446 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  44.39 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  44.99 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  43.79 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  39.43 
 
 		 448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.03 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  35.73 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  34.87 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  34.65 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  34.59 
 
 		 452 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  34.53 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.38 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.14 
 
 		 453 aa  250  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  35.38 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  34.15 
 
 		 450 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  36.98 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  32.51 
 
 		 454 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.71 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  34.71 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.71 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  34.36 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.71 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.41 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.2 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  33.57 
 
 		 479 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.43 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.43 
 
 		 480 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  33.89 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  33.73 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.2 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  33.73 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.96 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  32.88 
 
 		 450 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  32.59 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.04 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  33.89 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  32.74 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  32.74 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  33.55 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  33.49 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  33.57 
 
 		 480 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  34.65 
 
 		 475 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  32.94 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.77 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.01 
 
 		 476 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  32.69 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  33.25 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  33.25 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  32.54 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  30.8 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  36.01 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  33.25 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  32.52 
 
 		 481 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.82 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.82 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  31.85 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.82 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  33.01 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  32.44 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  32.44 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.2 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  31.58 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.89 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.49 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  32.95 
 
 		 456 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.07 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  32.78 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.32 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  32.38 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  32.95 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  30.34 
 
 		 492 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.33 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  35.22 
 
 		 455 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  31.71 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.71 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  30.36 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  34.46 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  31.57 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  30.42 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  31.65 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  30.51 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>