More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1846 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  88.96 
 
 		 480 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  88.96 
 
 		 480 aa  864    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  85.68 
 
 		 482 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  88.96 
 
 		 480 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  100 
 
 		 480 aa  953    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  98.33 
 
 		 480 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  67.15 
 
 		 480 aa  639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  89.17 
 
 		 480 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  83.75 
 
 		 480 aa  782    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  92.29 
 
 		 480 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  87.92 
 
 		 480 aa  856    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  68.34 
 
 		 479 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  85.68 
 
 		 482 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  65.39 
 
 		 494 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  60.78 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  62.37 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  55.62 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  56.83 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  56.83 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  56.83 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  55.15 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  55.64 
 
 		 492 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  55.64 
 
 		 492 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  53.04 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  47 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  44.47 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  45.08 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  48.24 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  43.15 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  43.3 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  42.73 
 
 		 452 aa  356  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  39.47 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  40.84 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  43.53 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  42.05 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  39.69 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  40.81 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  41.8 
 
 		 451 aa  339  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  39.41 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  39.41 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  39.41 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  39.27 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  39.16 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  39.02 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  41.82 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  38.46 
 
 		 454 aa  332  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  38.14 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  38.14 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  38.24 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  38.36 
 
 		 454 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  39.95 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  38.14 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  38.67 
 
 		 452 aa  322  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  39.81 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  38.6 
 
 		 451 aa  313  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  40.05 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  39.96 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  37.05 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  38.32 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  38.44 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  40 
 
 		 445 aa  294  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  38.82 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  38.41 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  37.26 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  37.91 
 
 		 471 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  34.61 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.93 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  37.44 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.48 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  37.47 
 
 		 471 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.24 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  37.1 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.05 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  34.48 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  36.69 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  34.37 
 
 		 445 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.88 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  39.53 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  35 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.31 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  38.35 
 
 		 463 aa  266  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.76 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.39 
 
 		 459 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.39 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.15 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  33.49 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.15 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.15 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.15 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  34.76 
 
 		 458 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  35.89 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.01 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  32.85 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  34.54 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  33.85 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  35.71 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  35.1 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  35.14 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  34.25 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>