More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2874 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  97.81 
 
 
456 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  93.2 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  77.53 
 
 
455 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  77.97 
 
 
458 aa  732    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  93.2 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  99.56 
 
 
456 aa  917    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  99.78 
 
 
456 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  78.29 
 
 
465 aa  742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  100 
 
 
456 aa  923    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  93.2 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  80.53 
 
 
454 aa  729    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  93.2 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  72.91 
 
 
472 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  91.67 
 
 
484 aa  841    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  46.86 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  45.96 
 
 
443 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  46.41 
 
 
448 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
446 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  45.07 
 
 
448 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  44 
 
 
448 aa  363  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  48.99 
 
 
445 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  44.79 
 
 
445 aa  352  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  40.38 
 
 
452 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  39.6 
 
 
475 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  39.73 
 
 
467 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  39.04 
 
 
467 aa  292  9e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  39.68 
 
 
453 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  38.13 
 
 
492 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  39.53 
 
 
463 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  40.43 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  36.88 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  36.19 
 
 
480 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  38.3 
 
 
452 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.87 
 
 
480 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  37.29 
 
 
422 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.59 
 
 
452 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.39 
 
 
480 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.52 
 
 
480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.6 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.52 
 
 
480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.18 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  35.48 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  35.96 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  35.84 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.31 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.31 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  35.84 
 
 
454 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  35.62 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  36.47 
 
 
454 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.15 
 
 
479 aa  270  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  35.55 
 
 
454 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  35 
 
 
480 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.76 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.25 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.25 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.25 
 
 
454 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.07 
 
 
455 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  35.2 
 
 
480 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  39.62 
 
 
452 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.78 
 
 
454 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  36.73 
 
 
453 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.69 
 
 
454 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  36.62 
 
 
450 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.47 
 
 
454 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.38 
 
 
454 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  33.03 
 
 
491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  33.03 
 
 
491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  33.03 
 
 
491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  33.11 
 
 
453 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  34.01 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  33.92 
 
 
452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  37.92 
 
 
455 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  33.93 
 
 
451 aa  252  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  33.49 
 
 
451 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.72 
 
 
453 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.11 
 
 
477 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  35.98 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  34.76 
 
 
480 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.17 
 
 
478 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.05 
 
 
481 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.79 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  31.6 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  32.63 
 
 
492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.93 
 
 
492 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.22 
 
 
471 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  34.95 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  34.59 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  32.48 
 
 
442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  34.41 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.08 
 
 
473 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  32.03 
 
 
462 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  34.5 
 
 
448 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  32.33 
 
 
478 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.53 
 
 
476 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.68 
 
 
470 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.33 
 
 
473 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  32.44 
 
 
462 aa  199  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  28.72 
 
 
445 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  29.18 
 
 
455 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  32.12 
 
 
473 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>