More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2060 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  100 
 
 		 492 aa  994    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  58.19 
 
 		 463 aa  501  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  57.79 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  58.56 
 
 		 467 aa  498  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  42.41 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  43.72 
 
 		 452 aa  340  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  38.46 
 
 		 452 aa  339  8e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  40.82 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  40.53 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  37.94 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  40.77 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  37.16 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.77 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  35.81 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  39.57 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  36.64 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  36.64 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  36.9 
 
 		 454 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  36.42 
 
 		 454 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  36.88 
 
 		 454 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  40.29 
 
 		 450 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  36.68 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  36.68 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  37.5 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  37.89 
 
 		 454 aa  309  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  41.39 
 
 		 443 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  39.81 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  37.08 
 
 		 455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  36.34 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.16 
 
 		 453 aa  306  8.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  38.61 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  36.51 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  38.7 
 
 		 453 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  38.24 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.1 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  40.09 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  38.32 
 
 		 480 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  39.59 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  38.78 
 
 		 480 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.93 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.32 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  37.42 
 
 		 480 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  38.13 
 
 		 456 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  38.02 
 
 		 448 aa  293  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  38.58 
 
 		 456 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  37.2 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  37.2 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  38.13 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  37.12 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  40.92 
 
 		 484 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  38.04 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  38.13 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  40.77 
 
 		 451 aa  289  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  38.76 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  37.03 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  38.51 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  38.51 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  36.93 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  37.7 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  37.7 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  38.51 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  38.51 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  36.09 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 446 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  40.58 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  36.96 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  36.87 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  36.28 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  36.28 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  36.28 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  37.42 
 
 		 481 aa  276  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  38.04 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  37.03 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  40.2 
 
 		 494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  37.56 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  36.92 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  39.36 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  36.6 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  38.04 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  34.57 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.85 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  38.08 
 
 		 445 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  35.21 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  34.27 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  34.45 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  40.67 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  34.05 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.19 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  34.85 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.35 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  34.98 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  32.58 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.59 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.41 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  32.41 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  32.18 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  32.14 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  31.23 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.71 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  35.9 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>