296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1301 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  91.45 
 
 
456 aa  861    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  77.3 
 
 
455 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  92.54 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  92.54 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  77.31 
 
 
458 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  92.54 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  91.89 
 
 
456 aa  866    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  91.67 
 
 
456 aa  864    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  77.41 
 
 
465 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  91.67 
 
 
456 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  79.87 
 
 
454 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  92.54 
 
 
456 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  72.41 
 
 
472 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  100 
 
 
484 aa  988    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  47.76 
 
 
448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  47.09 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  45.52 
 
 
448 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
446 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  45.73 
 
 
443 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  44.62 
 
 
448 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  44.55 
 
 
445 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  48.38 
 
 
445 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.86 
 
 
475 aa  296  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  40.9 
 
 
453 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  40.92 
 
 
492 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  39.67 
 
 
452 aa  289  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  38.36 
 
 
467 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  38.32 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.24 
 
 
480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  35.48 
 
 
480 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  39.48 
 
 
450 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.36 
 
 
453 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  35 
 
 
480 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.39 
 
 
480 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  38.21 
 
 
463 aa  279  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.52 
 
 
480 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.39 
 
 
480 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  38.06 
 
 
452 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  36.64 
 
 
448 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.13 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  34.83 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  34.83 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  34.68 
 
 
479 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  33.81 
 
 
480 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.05 
 
 
480 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  36.71 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  33.73 
 
 
480 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  36.58 
 
 
422 aa  267  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  38.24 
 
 
452 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  37.92 
 
 
450 aa  266  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  35.17 
 
 
454 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  35.17 
 
 
454 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  34.92 
 
 
454 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.93 
 
 
454 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.93 
 
 
454 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  35.08 
 
 
453 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  34.61 
 
 
454 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.24 
 
 
454 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.11 
 
 
454 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  36.49 
 
 
453 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  34.39 
 
 
455 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  32.11 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  38.95 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  32.11 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  32.11 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.24 
 
 
480 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.56 
 
 
477 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  35.78 
 
 
454 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  34.21 
 
 
452 aa  249  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.88 
 
 
454 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  34.21 
 
 
451 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  33.71 
 
 
451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.95 
 
 
453 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  35.49 
 
 
451 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  32.04 
 
 
481 aa  240  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  30.49 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  31.13 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  31.18 
 
 
492 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.14 
 
 
494 aa  233  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.47 
 
 
492 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  34.13 
 
 
471 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.6 
 
 
471 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  34.34 
 
 
456 aa  216  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  31.79 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  34.16 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  31.27 
 
 
473 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  31.87 
 
 
478 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  34.89 
 
 
448 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  35.42 
 
 
476 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  34.58 
 
 
470 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  28.21 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  36.19 
 
 
462 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  30.6 
 
 
473 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  28.2 
 
 
455 aa  192  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  31.33 
 
 
462 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  31.66 
 
 
445 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>