291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05323 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  72.54 
 
 
448 aa  680    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  89.73 
 
 
448 aa  808    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  890    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  68.97 
 
 
448 aa  625  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  47.2 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  47.31 
 
 
455 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  47.52 
 
 
454 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  49.64 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  46.41 
 
 
456 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  46.41 
 
 
456 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  46.41 
 
 
456 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  46.41 
 
 
456 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  47.11 
 
 
456 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  47.11 
 
 
456 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  45.37 
 
 
458 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  47.11 
 
 
456 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  47.11 
 
 
456 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  46.05 
 
 
472 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  44.12 
 
 
443 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  42.79 
 
 
445 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  43.22 
 
 
445 aa  326  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  38.26 
 
 
448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.87 
 
 
492 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  35.59 
 
 
452 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  35.54 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  37.32 
 
 
453 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  35.68 
 
 
463 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  37.53 
 
 
450 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  34.14 
 
 
467 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.14 
 
 
452 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  35.68 
 
 
453 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  33.57 
 
 
454 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.56 
 
 
479 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  33.17 
 
 
467 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  34.45 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.22 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  34.22 
 
 
454 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.22 
 
 
454 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.22 
 
 
454 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  33.97 
 
 
480 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  33.97 
 
 
480 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.81 
 
 
480 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  33.73 
 
 
480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  35.99 
 
 
450 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.98 
 
 
454 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  33.89 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  33.48 
 
 
480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  34.05 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.25 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  34.68 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  33.49 
 
 
480 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.01 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.01 
 
 
454 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.01 
 
 
454 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  35.58 
 
 
471 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  32.52 
 
 
454 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  32.37 
 
 
480 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  35 
 
 
451 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.56 
 
 
494 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  32.61 
 
 
480 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.06 
 
 
476 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  33.41 
 
 
481 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  32.86 
 
 
482 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  32.86 
 
 
482 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  36.99 
 
 
452 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  31.82 
 
 
453 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.2 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  31.96 
 
 
455 aa  223  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  33.81 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.33 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  33.09 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  34.47 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  32.12 
 
 
453 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.41 
 
 
473 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  31.96 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  34.21 
 
 
462 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  32.3 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  32.3 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  32.3 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  35.29 
 
 
456 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  33.33 
 
 
492 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  34.69 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  32.7 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.63 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.29 
 
 
471 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.52 
 
 
473 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  32.22 
 
 
451 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  32.95 
 
 
477 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  31.36 
 
 
442 aa  209  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  32.41 
 
 
492 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  31.28 
 
 
462 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  34.8 
 
 
461 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  32.58 
 
 
444 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  32.58 
 
 
459 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  34 
 
 
470 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.62 
 
 
471 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  36.64 
 
 
473 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  35.02 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  33.89 
 
 
471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>