More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1904 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  100 
 
 		 462 aa  911    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  67.5 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  64.4 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  64.69 
 
 		 459 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  66.15 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  64.46 
 
 		 459 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  58.55 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  53.91 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  51.08 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  47.9 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  52.07 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  51.21 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  51.24 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  50.49 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  52.12 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  52.56 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  52.25 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  51.79 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  51.65 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  48.66 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  46.65 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  50.94 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  50.22 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  53.22 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  51.12 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  48.3 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  51.21 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  34.53 
 
 		 456 aa  319  7.999999999999999e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  34.75 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  41.78 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  39.95 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39.67 
 
 		 422 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  33.18 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  41.44 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  41.8 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  36.51 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  39.53 
 
 		 480 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  38.84 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  39.3 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  38.02 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  38.84 
 
 		 480 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  38.84 
 
 		 480 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  37.08 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  38.6 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  37.68 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  38.89 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  38.89 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  37.12 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  38.39 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  39.43 
 
 		 480 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  38.25 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  37.23 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  35.96 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  38.14 
 
 		 480 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  39.91 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  41.83 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  36.97 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  39.32 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  37.35 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  37.2 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  38.94 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  39.32 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  37.2 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  37.44 
 
 		 454 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  37.2 
 
 		 454 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  36.05 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  36.2 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  36.2 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.73 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  36.1 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  36.14 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  35.06 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  37.59 
 
 		 479 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.98 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  38.68 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  40.57 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  38.79 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.23 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  38.52 
 
 		 455 aa  259  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  35.39 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  35.39 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  35.39 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  37.24 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  38.16 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  33.41 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  38.05 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  37.91 
 
 		 480 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  38.84 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  36.71 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  32.9 
 
 		 492 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  38.98 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  35.81 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.06 
 
 		 449 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  35.15 
 
 		 478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0465  magnesium transporter  34.81 
 
 		 437 aa  241  2.9999999999999997e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  34.84 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  36.41 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  35.28 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  31.47 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  34.54 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>