More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3075 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  80.04 
 
 		 472 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  90.49 
 
 		 473 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  87.32 
 
 		 473 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  82.66 
 
 		 473 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  100 
 
 		 473 aa  927    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  63.88 
 
 		 470 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  60.79 
 
 		 481 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  61.37 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  56.74 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  55.31 
 
 		 473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  56.3 
 
 		 471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  54.79 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  54.42 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  50 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  51.49 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  47.94 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  47.94 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  53.22 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  46.44 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  49.18 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  44.97 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  47.15 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  44.54 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  47.69 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  43.72 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  48.65 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3159  magnesium transporter  45.21 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  38.06 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  40.62 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  37.65 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  37.65 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  34.99 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0458  divalent cation transporter  34.57 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  34.99 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  34.99 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  34.94 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.71 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.71 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  35.92 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0571  magnesium transporter  34.57 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  38.05 
 
 		 449 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  31.91 
 
 		 456 aa  272  8.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.71 
 
 		 480 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  37.67 
 
 		 494 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.7 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.48 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  35.96 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.48 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.02 
 
 		 480 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  39.32 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  34.63 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  37.07 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  34.7 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  36.19 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.11 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.33 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.11 
 
 		 454 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.11 
 
 		 454 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  34.65 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  37.17 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.12 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  33.18 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  33.18 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  33.93 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  36.74 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  35.53 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  32.65 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  33.65 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.42 
 
 		 454 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  37.68 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  32.65 
 
 		 454 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  35.24 
 
 		 478 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  36.98 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  36.98 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  32.65 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  32.65 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.19 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.25 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  37 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  34.79 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.1 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  33.33 
 
 		 481 aa  253  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  37.44 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  33.41 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  32.12 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.05 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  34.86 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  36.69 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  35.55 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  33.72 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  32.79 
 
 		 492 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.21 
 
 		 449 aa  243  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  35.49 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  36.32 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  37.04 
 
 		 475 aa  240  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  34.34 
 
 		 492 aa  240  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  37.11 
 
 		 455 aa  239  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  32.53 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>