More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0471 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  100 
 
 
482 aa  974    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  42 
 
 
450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  40.8 
 
 
445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  40 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  40.05 
 
 
445 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  38.82 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.65 
 
 
444 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  35.29 
 
 
542 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  36.17 
 
 
451 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  36.43 
 
 
484 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  39.24 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  38.55 
 
 
473 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  37.01 
 
 
454 aa  269  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  38.42 
 
 
479 aa  267  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  37.39 
 
 
442 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  40.77 
 
 
470 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  38.39 
 
 
462 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  37.04 
 
 
463 aa  263  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.44 
 
 
461 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.44 
 
 
461 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  34.91 
 
 
471 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  35.18 
 
 
480 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  36.5 
 
 
473 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  36.52 
 
 
460 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  35.04 
 
 
478 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  36.54 
 
 
481 aa  257  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  38.85 
 
 
455 aa  257  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.71 
 
 
450 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  36.74 
 
 
480 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  35.78 
 
 
455 aa  256  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.42 
 
 
480 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1221  Mg/Co/Ni transporter, MgtE family  36.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00221531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.92 
 
 
471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.94 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.18 
 
 
480 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.88 
 
 
481 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.18 
 
 
480 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.18 
 
 
480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  35.28 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  35.23 
 
 
452 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  35.18 
 
 
480 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  34.31 
 
 
491 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  34.31 
 
 
491 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  34.31 
 
 
491 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  37.81 
 
 
461 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  35.42 
 
 
480 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.7 
 
 
480 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  34.91 
 
 
442 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  37.53 
 
 
479 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.77 
 
 
454 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  38.65 
 
 
461 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  36.64 
 
 
461 aa  250  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  35.27 
 
 
452 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  36.24 
 
 
471 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  36.9 
 
 
422 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  34.89 
 
 
450 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  37.08 
 
 
470 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.77 
 
 
454 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  36.13 
 
 
482 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  36.13 
 
 
482 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0697  magnesium transporter  37.96 
 
 
453 aa  248  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0542527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.44 
 
 
455 aa  247  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.49 
 
 
481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  36.08 
 
 
468 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  39.79 
 
 
476 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  33.79 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  33.56 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  35.92 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.7 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  36.27 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  34.95 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  37.22 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  35.23 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  35.98 
 
 
463 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.68 
 
 
471 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  36.39 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.54 
 
 
454 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  33.71 
 
 
453 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  34.97 
 
 
454 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.82 
 
 
465 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.97 
 
 
454 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.97 
 
 
454 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  35.5 
 
 
462 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  37.71 
 
 
473 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  36.22 
 
 
450 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.66 
 
 
458 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.88 
 
 
481 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  35.29 
 
 
444 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  37.07 
 
 
473 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  35.29 
 
 
459 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.24 
 
 
451 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.7 
 
 
468 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  35.38 
 
 
469 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  34.75 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  35.45 
 
 
469 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  34.9 
 
 
454 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  33.78 
 
 
468 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.89 
 
 
446 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  37.83 
 
 
473 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  36.87 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>