More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0721 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  79.07 
 
 		 454 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  750    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  89.43 
 
 		 454 aa  830    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  78.85 
 
 		 454 aa  739    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  90.11 
 
 		 455 aa  830    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  100 
 
 		 454 aa  911    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  747    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  79.07 
 
 		 454 aa  739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  79.96 
 
 		 454 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  79.74 
 
 		 454 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  92.95 
 
 		 454 aa  857    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  80.18 
 
 		 454 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  79.07 
 
 		 454 aa  740    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  79.07 
 
 		 454 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  62.11 
 
 		 453 aa  588  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  61.87 
 
 		 453 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  62.27 
 
 		 452 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  58.06 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  58.22 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  62.05 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  59.51 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  60.58 
 
 		 451 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  50.56 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  51.25 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  50.11 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  49.44 
 
 		 452 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  49.11 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  47.27 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  45.23 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  44.62 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  45 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  40.85 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  40.32 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  38.46 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  40.14 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.02 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  41.11 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  40.42 
 
 		 480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  40.18 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  40.18 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  41.8 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  39.13 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  41.27 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  37.64 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  37.64 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  37.41 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.34 
 
 		 492 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  37.7 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  37.21 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  35.29 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  35.29 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  35.29 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  38.22 
 
 		 480 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.34 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  38.53 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  35.73 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  36.12 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  37.47 
 
 		 478 aa  279  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.86 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  34.53 
 
 		 492 aa  276  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  34.99 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  34.75 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.64 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  34.99 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.91 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  36.88 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  34.69 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  34.69 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.76 
 
 		 458 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.24 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  34.47 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  34.66 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.44 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.41 
 
 		 442 aa  259  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  34.82 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.56 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.71 
 
 		 459 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  34.63 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  33.71 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  35.06 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  34.78 
 
 		 465 aa  255  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  36.23 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  35.06 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  35.93 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  34.47 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  34.47 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  33.65 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  34.47 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  34.47 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  34.05 
 
 		 479 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  34.85 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  30.97 
 
 		 473 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  35.22 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  33.56 
 
 		 472 aa  249  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  34.43 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.77 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  35.55 
 
 		 459 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.44 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>