More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1125 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  100 
 
 
444 aa  899    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  63.07 
 
 
460 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  53.96 
 
 
542 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  62.44 
 
 
467 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  59.42 
 
 
456 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  35.39 
 
 
445 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  35.39 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  37.96 
 
 
452 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.65 
 
 
482 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  38.11 
 
 
449 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  34.27 
 
 
451 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  35.95 
 
 
484 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.42 
 
 
461 aa  259  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.42 
 
 
461 aa  259  9e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  34.74 
 
 
442 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  35.01 
 
 
473 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  35.14 
 
 
450 aa  249  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.25 
 
 
450 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  34.4 
 
 
461 aa  247  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  37.35 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  34.86 
 
 
481 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  35.55 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  34.93 
 
 
453 aa  235  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  35.06 
 
 
469 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.01 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  34.82 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  34.03 
 
 
479 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  33.87 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.34 
 
 
462 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  36.89 
 
 
470 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  33.89 
 
 
469 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  33.97 
 
 
463 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  32.34 
 
 
462 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  32.62 
 
 
481 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  33.96 
 
 
468 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.83 
 
 
454 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.84 
 
 
471 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  33.96 
 
 
468 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  33.57 
 
 
468 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35 
 
 
465 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  33.81 
 
 
422 aa  226  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  34.53 
 
 
472 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  35.25 
 
 
473 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  32.8 
 
 
454 aa  224  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  32.23 
 
 
454 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  32.23 
 
 
454 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.74 
 
 
454 aa  223  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.23 
 
 
454 aa  223  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  33.97 
 
 
462 aa  222  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  31.98 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  32.91 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  31 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  32.45 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.74 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.03 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  32.54 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.49 
 
 
471 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.98 
 
 
454 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  34.46 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.1 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.1 
 
 
459 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.9 
 
 
473 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  33.89 
 
 
449 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  30.91 
 
 
480 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31.73 
 
 
454 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31.73 
 
 
454 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31.73 
 
 
454 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  35.95 
 
 
461 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  30.73 
 
 
450 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  34.49 
 
 
473 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  33.42 
 
 
453 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  32.39 
 
 
450 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  31.16 
 
 
480 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  31.98 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  31.56 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  30.61 
 
 
480 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.22 
 
 
471 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  30.21 
 
 
453 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  30.56 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  29.72 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  29.72 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  31.28 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  29.72 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  34.29 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  31.59 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  29.17 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  32.71 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  33.89 
 
 
463 aa  213  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  33.97 
 
 
486 aa  213  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  32.05 
 
 
462 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  32.01 
 
 
451 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  30.47 
 
 
480 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  30.93 
 
 
480 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  30.93 
 
 
480 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  29.89 
 
 
446 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  29.43 
 
 
478 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  34.09 
 
 
453 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  31.41 
 
 
482 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  31.14 
 
 
461 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  31.41 
 
 
482 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>