More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1855 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  100 
 
 
450 aa  889    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  60.05 
 
 
484 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  43.27 
 
 
445 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  43.34 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  40.8 
 
 
482 aa  332  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  41.99 
 
 
449 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  37.62 
 
 
442 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  34.15 
 
 
451 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.52 
 
 
452 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.62 
 
 
461 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.62 
 
 
461 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.43 
 
 
461 aa  275  9e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  32.65 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  34.15 
 
 
471 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.14 
 
 
444 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  33.03 
 
 
482 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  31.96 
 
 
480 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  35.75 
 
 
471 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  33.03 
 
 
482 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  31.21 
 
 
480 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  30.77 
 
 
480 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  30.77 
 
 
480 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.04 
 
 
481 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.51 
 
 
465 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  33.03 
 
 
444 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.22 
 
 
491 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  33.03 
 
 
459 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.22 
 
 
491 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.22 
 
 
491 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  31.12 
 
 
480 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  31.12 
 
 
480 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  31.21 
 
 
479 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  34.68 
 
 
473 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  32.81 
 
 
479 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  30.89 
 
 
480 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  34.89 
 
 
450 aa  255  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.2 
 
 
470 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  39.9 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  34.28 
 
 
450 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  32.28 
 
 
480 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  32.94 
 
 
485 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  31.44 
 
 
480 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.88 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  32.12 
 
 
542 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  36.04 
 
 
473 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  34.15 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  32.77 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  35.75 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  34.87 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.8 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  35.08 
 
 
471 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  30.42 
 
 
477 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  31.63 
 
 
494 aa  243  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  33.1 
 
 
462 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  32.86 
 
 
453 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  33.26 
 
 
459 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  32.17 
 
 
453 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  33.9 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  34.13 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  33.64 
 
 
454 aa  239  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  33.01 
 
 
422 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  35.28 
 
 
462 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.42 
 
 
449 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  31.14 
 
 
481 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  34.9 
 
 
473 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  31.26 
 
 
452 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  34.52 
 
 
471 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  30.63 
 
 
462 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  33.01 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.6 
 
 
453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  34.36 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  34.47 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32.37 
 
 
468 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  29.76 
 
 
453 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.52 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  32.77 
 
 
462 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  36.23 
 
 
473 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  30.9 
 
 
454 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  37.24 
 
 
455 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  34.38 
 
 
463 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  32.47 
 
 
454 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.97 
 
 
458 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  32.21 
 
 
460 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  31.25 
 
 
463 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  29.65 
 
 
492 aa  229  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.57 
 
 
492 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.53 
 
 
454 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  33.25 
 
 
452 aa  229  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  32.24 
 
 
454 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  29.47 
 
 
443 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.07 
 
 
454 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0375  magnesium transporter  33.66 
 
 
456 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  31.01 
 
 
466 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  31.74 
 
 
444 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  32.24 
 
 
454 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.13 
 
 
460 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  32 
 
 
454 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  34.38 
 
 
472 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  30.18 
 
 
452 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.09 
 
 
442 aa  226  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>