More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0589 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  100 
 
 
461 aa  931    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  82.17 
 
 
461 aa  781    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  82.17 
 
 
461 aa  781    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  41.32 
 
 
454 aa  332  8e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  38.65 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  38.64 
 
 
451 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  37.53 
 
 
445 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  37.02 
 
 
445 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  38.57 
 
 
442 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.77 
 
 
453 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  34.03 
 
 
542 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  33.85 
 
 
452 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  34.38 
 
 
449 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  31.96 
 
 
450 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.88 
 
 
444 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  35.43 
 
 
450 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  34.22 
 
 
449 aa  259  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  34.22 
 
 
463 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  35.95 
 
 
484 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  36.5 
 
 
451 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  31.19 
 
 
452 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  39.17 
 
 
462 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  34.66 
 
 
468 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  35.48 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  34.66 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  34.76 
 
 
482 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  33.26 
 
 
466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  35.24 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.25 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  34.16 
 
 
468 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  34.16 
 
 
469 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  33.02 
 
 
444 aa  249  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  31.89 
 
 
449 aa  249  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.19 
 
 
465 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  31.76 
 
 
454 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.18 
 
 
473 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.26 
 
 
460 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.32 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.81 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32.67 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  35.89 
 
 
456 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.21 
 
 
443 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  32.51 
 
 
451 aa  242  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.41 
 
 
449 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  36.83 
 
 
486 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  32.18 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  34.75 
 
 
454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  34.11 
 
 
470 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  36.7 
 
 
486 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.27 
 
 
446 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  32.56 
 
 
449 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  34.13 
 
 
454 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  35.18 
 
 
454 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  32.46 
 
 
455 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  31.54 
 
 
460 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  32.81 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31 
 
 
462 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  34.5 
 
 
456 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  30.58 
 
 
447 aa  232  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  31.01 
 
 
463 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.3 
 
 
459 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  31.45 
 
 
444 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  28.57 
 
 
449 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.43 
 
 
460 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  30.67 
 
 
456 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  36.24 
 
 
461 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  33 
 
 
450 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  30.09 
 
 
471 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  29.91 
 
 
454 aa  228  2e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  30.79 
 
 
447 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  35.41 
 
 
467 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  30.51 
 
 
450 aa  226  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  33.18 
 
 
462 aa  226  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  34.35 
 
 
454 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  36.86 
 
 
473 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  29.36 
 
 
449 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  30.02 
 
 
462 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  29.81 
 
 
471 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  31.69 
 
 
485 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.8 
 
 
473 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  30.8 
 
 
460 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  36.24 
 
 
465 aa  224  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  31.92 
 
 
458 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  36.24 
 
 
465 aa  224  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  34.75 
 
 
441 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  34.32 
 
 
471 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.43 
 
 
458 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  31.69 
 
 
472 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  36.51 
 
 
438 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  30.34 
 
 
463 aa  221  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  34.28 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  34.28 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  30.36 
 
 
454 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.89 
 
 
470 aa  220  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.21 
 
 
460 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  30.66 
 
 
462 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  34.74 
 
 
457 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  29.3 
 
 
449 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  30.05 
 
 
476 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>