More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0582 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  100 
 
 
467 aa  934    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  96.57 
 
 
467 aa  877    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  73.22 
 
 
463 aa  632  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  57.79 
 
 
492 aa  518  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  40.36 
 
 
453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  42.41 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  36.34 
 
 
454 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  36.22 
 
 
454 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  39.64 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  36 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  39.04 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  39.04 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  41.55 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  39.04 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  39.47 
 
 
458 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  35.78 
 
 
454 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  35.78 
 
 
454 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  35.89 
 
 
454 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  35.89 
 
 
454 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  35.89 
 
 
454 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  37.25 
 
 
452 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  38.07 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  36.79 
 
 
454 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  38.7 
 
 
422 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  35.52 
 
 
454 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.42 
 
 
465 aa  292  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  38.79 
 
 
484 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  36.24 
 
 
450 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  36.65 
 
 
475 aa  290  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  37.77 
 
 
456 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  37.77 
 
 
456 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  37.77 
 
 
456 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  37.77 
 
 
456 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.71 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.21 
 
 
454 aa  287  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  34.45 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  36.76 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  36.24 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  34.99 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  38.23 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
446 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  36.1 
 
 
453 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  38.06 
 
 
454 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  37.02 
 
 
453 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.02 
 
 
454 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  35.14 
 
 
455 aa  280  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  35.4 
 
 
453 aa  280  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  37.35 
 
 
443 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  37.84 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  34.54 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  34.54 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  34.54 
 
 
491 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  35.84 
 
 
452 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  34.87 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  36.06 
 
 
451 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  36.96 
 
 
453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  37.23 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  37.53 
 
 
455 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.62 
 
 
479 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.78 
 
 
480 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.35 
 
 
451 aa  266  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  35.44 
 
 
448 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.3 
 
 
480 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  34.14 
 
 
448 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  33.41 
 
 
492 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  36.88 
 
 
442 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  35.18 
 
 
480 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.95 
 
 
476 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  33.82 
 
 
480 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  35.27 
 
 
492 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  34.59 
 
 
463 aa  257  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.54 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.54 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.54 
 
 
480 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.54 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  34.38 
 
 
482 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  34.38 
 
 
482 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  34.3 
 
 
480 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  33.88 
 
 
448 aa  250  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  34.94 
 
 
445 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.56 
 
 
477 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  32.9 
 
 
471 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  35.14 
 
 
448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.81 
 
 
494 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  35.1 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  34.65 
 
 
471 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.88 
 
 
478 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  34.21 
 
 
471 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.57 
 
 
473 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  34.03 
 
 
471 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  32.49 
 
 
481 aa  237  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  36.87 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  33.26 
 
 
454 aa  230  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  33.5 
 
 
481 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  34.06 
 
 
480 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  32.31 
 
 
473 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  31.54 
 
 
470 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  34.78 
 
 
461 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  33.48 
 
 
470 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  32.89 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>