More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2551 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  77.75 
 
 		 456 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  78.19 
 
 		 456 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  74.45 
 
 		 472 aa  693    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  75.28 
 
 		 455 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  78.19 
 
 		 456 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  100 
 
 		 458 aa  919    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  78.19 
 
 		 456 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  78.41 
 
 		 456 aa  737    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  78.19 
 
 		 456 aa  735    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  82.2 
 
 		 465 aa  775    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  77.97 
 
 		 456 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  75.88 
 
 		 454 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  78.19 
 
 		 456 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  77.31 
 
 		 484 aa  720    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  46.05 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  45.37 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  45.56 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  43.38 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  42.89 
 
 		 448 aa  355  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  47.24 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  43.09 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  42.51 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  39.59 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  39.78 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  38.39 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  38.41 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  39.47 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  37.74 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  35.62 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  39.52 
 
 		 422 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  37.36 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  37.36 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  38.55 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  37.13 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  37.13 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  40.14 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  37.3 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  40.86 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  36.64 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  37.68 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  36.64 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  36.42 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  39.61 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  36.45 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  37.03 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  35.63 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  35.95 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  35.63 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  36.97 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  37.05 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  35.99 
 
 		 454 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  37.5 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  35.24 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  35.76 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  34.76 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  34.76 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.52 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  36.16 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  38.8 
 
 		 453 aa  263  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.52 
 
 		 480 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  34.52 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.78 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.78 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.76 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  35.31 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  35.32 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  39.06 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  36.16 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  31.88 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  31.88 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  39.29 
 
 		 455 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  31.88 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  37.23 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  35.24 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  35.07 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  33.26 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  34.71 
 
 		 494 aa  239  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  32.38 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  34.29 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  33.33 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.83 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  34.91 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  33.74 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  30.33 
 
 		 478 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  33.25 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.55 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  32.95 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  33.58 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  33.15 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  35.5 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  36.56 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  32.3 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.52 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  34.91 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  33.07 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  31.44 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  33.85 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  30.89 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  32.35 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>