282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000256 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  100 
 
 		 448 aa  904    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  46.15 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  34.66 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.5 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.89 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  33.91 
 
 		 465 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  34.13 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  34.5 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  34.5 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  34.5 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.36 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.36 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.36 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.36 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  35.31 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  34.62 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  36.5 
 
 		 448 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  33.8 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  34.32 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  36.36 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  35.06 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  35.85 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  35.02 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  32.33 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  34.46 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  32.35 
 
 		 472 aa  209  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  32.61 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  31.66 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  36.34 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  31.66 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  31.44 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  31.44 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  33.02 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.57 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  33.95 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  33.1 
 
 		 475 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  32.78 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.36 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.36 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  32.36 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  32.36 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  32.01 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  33.33 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  32.55 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  32.81 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  32.78 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  32.31 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  32.31 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  31.78 
 
 		 480 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  32.73 
 
 		 467 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  30.95 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  32.95 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  31.25 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  32.95 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  30.84 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  28.86 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  28.86 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  28.86 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  30.13 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  30.61 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  31.46 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  30.71 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  33.11 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  30.21 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  31.13 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  29 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  30 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  29.57 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  30.66 
 
 		 454 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  27.99 
 
 		 473 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  30.95 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  28.44 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  31.78 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  28.44 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  28.32 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  29 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  31.47 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  28.41 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  30.3 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  31.71 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  30.86 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  28.64 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  26.94 
 
 		 481 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  33.53 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  29.69 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  29.36 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  29.74 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  30.46 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  27.63 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  28.16 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  30.98 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  29.5 
 
 		 450 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  31.58 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  31.41 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  32.35 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  27.11 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  28.61 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.75 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  31.96 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>